本教研室曾多次获得教学奖励，刘斌和唐军民教授主编的5部教材获得了国家级、卫生部、教育部和北京市的奖励；唐军民教授负责的《组织学与胚胎学》课程荣获北京市精品课程；教学团队多次荣获北京大学医学部及基础医学院“优秀教学团队”称号。吴俊、任彩霞、魏潇凡老师获得北京市教学比赛嘉奖；战军获“中国青年解剖科学家”称号。